Przeważnie na zabieg przeszczepienia włosów decydują się mężczyźni dotknięci łysieniem typu androgenowego. Łysienie androgenowe typu męskiego stanowi najczęstsze wskazanie do przeszczepu, gdyż w jego przebiegu utrata włosów jest ograniczona do określonego obszaru. Istnieje część mieszków włosowych w określonych rejonach skóry głowy odporna całkowicie na działanie androgenów. Stąd więc istnieje zazwyczaj odpowiednie miejsce do pobrania włosów do przeszczepu.

Zabieg bywa też wskazany u kobiet i mężczyzn (także u młodzieży) z częściowym pourazowym wyłysieniem danej partii skóry.